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微生物多样性分析
宏基因组学
宏转录组学
基因组学
转录组学
蛋白组学
代谢组学
微生物多样性分析
如果您的样品需要低温寄送,4℃左右可用冰袋寄送,-20℃和-80℃请干冰寄送。
如果需要我们为您提供干冰,干冰寄送时间需要1-2天,请提前联系我们的技术顾问。
如果有任何疑问,可联系光衍未来项目经理。
送样须知
1. 请务必认真填写各项内容
2. 寄送样品时请您附带一份送样单
3. 如样品质检不合格将收取部分提取费用,请悉知
4. 不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性
5. 建议每样检测3个以上生物学重复(按多个样品收费)
需要提供
1. 污泥、土壤采样后置于无菌离心管内,短期可置于-20度,长期置于-80度保存,低温寄送,样品量3g+;
2. 动物粪便及肠道内容物,由于动物体内多种酶类可能会发生生物降解,取样器材尽量灭菌,用无菌离心管装样后寄送,长期保存于-80,干冰寄送,样品量不足时可以多次取样收集,样品量根据具体动物类型决定;
3. 水体样品可选用0.22 μm或者0.45 μm的滤膜过滤后寄送滤膜,一般一次送1-2张/样。
已测试
62
次 平均
7
个工作日完成
100%
对测试结果满意
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宏基因组学
如果您的样品需要低温寄送,4℃左右可用冰袋寄送,-20℃和-80℃请干冰寄送。
如果需要我们为您提供干冰,干冰寄送时间需要1-2天,请提前联系我们的技术顾问。
如果有任何疑问,可联系光衍未来项目经理。
一、项目介绍
宏基因组学(Metagenomics)通过全基因组重测序(Whole Genome Shotgun, WGS),以特定环境中所有微生物基因组为研究对象,获取环境样品中的全基因组DNA,将提取获得的微生物组总 DNA 随机打断为短片段,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端 (Paired-end,PE) 高通量测序,展示微生物群落结构多样性,微生物群体基因组成及功能,特定环境相关的代谢通路等分析,从而进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互关系。宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。
二、交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,根据实验进展确认,结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
样品要求
1. 环境样本:土壤5-10 g,污泥/沉积物5-10 g,水体-滤膜过滤至有可见覆盖物,粪便3-5 g,血液10 mL;
2. DNA:总量 ≥ 1 μg,浓度 ≥ 10 ng/μL,OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解,无污染;
3. 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封;
4.样品保存期间切忌反复冻融,送样时使用干冰运输。
已测试
9
次 平均
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个工作日完成
100%
对测试结果满意
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宏转录组学
宏转录组(Metatranscriptome)测序是指从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段,它以RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。获取微生物组总RNA并去除rRNA之后,反转录为cDNA,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端(Paired-end,PE)高通量测序,从而能精确定量整个菌群中具有活性的物种精细组成及其对应功能的表达水平,进而锁定菌群中的关键生物标记物、阐明其生物学意义。
样品要求
1. RNA:浓度≥100 ng/μL,总量≥4 μg,并确保RNA无降解;
2. cDNA:浓度≥20 ng/μL,总量≥1 μg,必须是双链cDNA;
3. 土壤、污泥等原样,至少提供1.5g;
4. 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封;
5. 样品保存期间切忌反复冻融,送样时使用干冰运输。
交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
已测试
9
次 平均
7
个工作日完成
100%
对测试结果满意
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基因组学
基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的结构、相互关系及表达调控的科学。基因组组学主要包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),包括基因组测序和分析,通过使用高通量DNA测序和生信分析来组装和分析整个基因组的功能和结构。
样品要求:
1. 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封;
2. 样品保存期间切忌反复冻融,送样时前请提前确认送样条件。
交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,根据实验进展定,可能会变化,结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
已测试
9
次 平均
7
个工作日完成
100%
对测试结果满意
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转录组学
转录组测序是对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,既可以提供定量分析,检测基因表达水平差异,又可以提供结构分析,能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合、SNP以及Indel位点等,而且不依赖于参考基因组。转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。
样品要求
1. RNA:浓度≥100 ng/μL,总量≥4 μg,并确保RNA无降解。
2. cDNA:浓度≥20 ng/μL,总量≥1 μg,必须是双链cDNA。
3. 送样管务必标清样品编号,管口使用封口膜密封。
4. 样品保存期间切忌反复冻融,送样时使用干冰运输。
交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,根据实验进展定,可能会变化,结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
已测试
9
次 平均
7
个工作日完成
100%
对测试结果满意
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蛋白组学
如果您的样品需要低温寄送,4℃左右可用冰袋寄送,-20℃和-80℃请干冰寄送。
如果需要我们为您提供干冰,干冰寄送时间需要1-2天,请提前联系我们的技术顾问。
如果有任何疑问,可联系光衍未来项目经理。
一、项目介绍
蛋
白质组学(Proteomics),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。主要是利用高分辨蛋白质分离技术和高效的蛋白鉴定技术,在蛋白质水平上整体、动态以及定量地研究生命现象和规律,是系统生物学的有机组成分。目前科学指南针提供TMT、iTRAQ、Label free、靶向蛋白组学等多种蛋白质组学技术,这些技术广泛应用于蛋白质的定性和定量分析。
二、交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,根据实验进展定,可能会变化。
结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
样品要求:
1. 样品管上名称和表中样品编号务必保持一致,除名称以外,请勿将其他信息标记于管盖,以避免出现可能的识别错误,后续分析报告按样品编号输出。
2. 锡纸包装的组织样品,将样品名称写在标签纸上并和样品一起装入塑封袋中,避免低温冰冻造成的样品名称无法识别。
3. 样品量要求具体和项目经理确认。
已测试
12
次 平均
7
个工作日完成
100%
对测试结果满意
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代谢组学
如果您的样品需要低温寄送,4℃左右可用冰袋寄送,-20℃和-80℃请干冰寄送。
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代谢组学(metabolomics)是在后基因组学时代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的研究生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动态反应。
组学技术服务涵盖非靶向代谢组学、靶向代谢组学以及其他代谢组学(Lipidomics)三大检测。
非靶向代谢组,对样本进行全面的、无侧重的检测,通过比较找出差异代谢产物,并结合生物信息分析,找出富集差异通路,整合代谢网络。该检测旨在提供一个全面的研究视角来比较差异,通常用于标志物的筛选、分子机制研究及多组学整合分析。
靶向代谢组学,即对明确的代谢产物进行定量分析检测,具有特异性强,检测灵敏度高和定量准确等特点,为后续深入代谢组学以及分子机制研究提供有力证据。
脂质组学作为其他代谢组学重要分支,旨在系统分析生物体脂质分子组成、特性以及表达变化,为研究其在基因调控与蛋白表达过程中的作用提供有力支持。
样品要求
1.样品管上名称和表中样品编号务必保持一致,除名称以外,请勿将其他信息标记于管盖,以避免出现可能的识别错误,后续分析报告按样品编号输出。
2.锡纸包装的组织样品,将样品名称写在标签纸上并和样品一起装入塑封袋中,避免低温冰冻造成的样品名称无法识别。
3.样品量要求具体和项目经理确认。
交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,根据实验进展定,可能会变化,结果反馈请在测试完成一周内反馈给光衍未来工作人员。
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四级杆飞行时间串联液质联用仪
主要功能:生物代谢组的液质检测
主要技术指标:更低的残留可实现无可比拟的数据质量 — 1290 Infinity II Multisampler 具有多重清洗功能,可将残留降至 10 ppm 以下,即使是极具挑战的化合物(例如,氯己啶)亦是如此
主要学科领域:药学
服务内容:生物代谢组的液质检测
用户须知:
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