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振动圆二色谱

计算内容：振动圆二色谱 (Vibrational Circular Dichroism)
（1）定义：振动圆二色谱是在红外波长区域测定分子圆二色性的一种方法。极大地扩展了圆二色谱法通过构象搜索、量子化学计算等手段准确预测手性分子的振动圆二色谱图，进而与实测谱图进行比较确定其绝对构型。是有效测定手性分子绝对构型的常规方法。
（2）说明：The predicted VCD spectrum for (S, R_mp) shows a positive band at 1541 cm^-¹ and negative band at 1526 cm^-¹, both of roughly equal magnitudes. Visualization of the vibrations responsible for this bisignate feature reveals a combination of Amide II and C-C stretching of neighboring benzene ring. All three such amide-benzene groups are participating to produce the respective vibrations along the macrocycle. The predicted VCD spectrum for (S, S_mp) shows a triplet of neighboring bands, with large positive at 1513 cm^-¹ and two weak negative bands one on each side. Visualization of the vibrations responsible for 1513 cm^-¹ band reveals it to also be a concerted Amide II and benzene ring C-C stretching vibration but localized to the benzene ring closest to the stereocenter. It is somewhat difficult to draw a definitive conclusion on the AC of 1 based solely on this region of the experimental VCD spectrum. In addition, the commonly used similarity analyses between experimental and theoretical VCD spectra are unreliable when there are only a small number of spectral features for comparison (see ESI). However, there are two experimental VCD bands that have favorable comparisons with those in the predicted spectrum for (S, R_mp), but not in that for (S, S_mp).
文献来源：DOI: 10.1002/chir.23365

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电子圆二色谱

计算内容：电子圆二色谱（Electronic circular dichroism）
（1）定义：测定蛋白质的立体结构圆二色性对R和L两种圆偏振光吸收程度不同的现象，这种吸收程度的不同与波长的关系称圆二色谱，是一种测定分子不对称结构的光谱法
（2）作用：在分子生物学领域中主要用于测定蛋白质的立体结构，也可用来测定核酸和多糖的立体结构。

（3）说明：The origin-independent velocity rotational strengths, weighted by the conformational populations given in Table 2, are plotted in Figure 15, together with the conformationally averaged ECD spectra, obtained by using Gaussian bandshapes6c with bandwidth parameters σ ) 0.2 and 0.4 eV. Both B3LYP and B3PW91 functionals give very similar ECD spectra. In both cases, the ECD spectrum exhibits an intense band at ∼300 nm, of positive sign for S-2, and weaker bands of oscillating sign at higher energies. The qualitative agreement with the experimental ECD of (+)-2 is excellent, and very bad for (-)-2, unambiguously confirming that the AC of 2 is S(+)/R(-)

文献来源：doi:10.1021/jo070302k

1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。
量子化学（quantum chemistry）是理论化学的一个分支学科，是应用量子力学的基本原理和方法研究化学问题的一门基础科学。研究范围包括稳定和不稳定分子的结构、性能及其结构与性能之间的关系；分子与分子之间的相互作用；分子与分子之间的相互碰撞和相互反应等问题。
适合的研究方向包括但不限于：有机合成、方法学研究、高分子等
可以计算的体系包括但不限于：小分子、团簇、低聚物、自由基、离子等
常用软件：Gaussian，ORCA，dmol3等
可以计算的内容包括但不限于：
分子性质，如键长键角二面角、HOMO/LUMO、电荷分布、键级、偶极矩、极化率、芳香性、静电势、Fukui函数、激发态研究等
光谱预测，如红外、紫外、拉曼、荧光、磷光、核磁、圆二色谱、旋光度等
能量计算，如结合能、解离能、电离能、弱相互作用分析等
反应相关，如过渡态搜索、势能面扫描、反应位点预测、反应路径、反应机理研究等
样品要求：结构明确

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静电势分析

计算内容：静电势分析

静电势所呈现的性质与其物理意义有直观的呼应。静电势的实际物理意义，等于将一个单位正电荷放在某处后它与此分子产生的静电相互作用能。因静电势分析的图形美观且对于分析相关课题有较多文献支撑，故被大量科研工作者青睐。通常文献中报道的静电势是以电子密度为0.001 e/bohr³的等值面作为分子范德华表面，然后此处静电势以颜色填色在该表面。

静电势分析可被用来

1）做反应位点分析（通常认为静电势越负（越正）位置的原子越容易发生亲电（亲核）反应）

2）预测分子间弱相互作用时候的相对构型（该预测对静电作用主导的弱相互作用有很好的定性意义）

3）其他以静电势为描述符推导其他性质的应用

说明：Molecular electrostatic potential surface (MEPs) mapped on the molecular surface provides a clear information in terms of the electrophilic and nucleophilic attack region of the molecule. The electrophilic reactivity is represented by the negative potential, while the nucleophilic reactivity is denoted by the positive potential。The values of MEP are closely related to the strength of intermolecular interactions between two molecules and is critical for understanding and evaluating the formation possibility of multicomponent crystals. Figure 11 shows the MEPs mapped on van der Waals (vdW) surface of APZ and co-former molecules where red color represents the value of positive potential, blue color represents the negative potential value, and black color represents the calculated pKa value.

文献来源：https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.cgd.0c00022
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9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

量子化学（quantum chemistry）是理论化学的一个分支学科，是应用量子力学的基本原理和方法研究化学问题的一门基础科学。研究范围包括稳定和不稳定分子的结构、性能及其结构与性能之间的关系；分子与分子之间的相互作用；分子与分子之间的相互碰撞和相互反应等问题。

适合的研究方向包括但不限于：有机合成、方法学研究、高分子等

可以计算的体系包括但不限于：小分子、团簇、低聚物、自由基、离子等

常用软件：Gaussian，ORCA，dmol3等

可以计算的内容包括但不限于：

分子性质，如键长键角二面角、HOMO/LUMO、电荷分布、键级、偶极矩、极化率、芳香性、静电势、Fukui函数、激发态研究等

光谱预测，如红外、紫外、拉曼、荧光、磷光、核磁、圆二色谱、旋光度等

能量计算，如结合能、解离能、电离能、弱相互作用分析等

反应相关，如过渡态搜索、势能面扫描、反应位点预测、反应路径、反应机理研究等

样品要求：结构明确

已测试 339 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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