设备预约-光衍未来

分子模拟计算模拟平台

1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

星蕴 CST 系列：GPU 加速计算可以提供非凡的应用程序性能，能将应用程序计算密集部分的工作负载转移到 GPU，同时仍由 CPU 运行其余程序代码。从用户的角度来看，应用程序的运行速度明显加快。星蕴 CST 系列 GPU 计算服务器采用 NVIDIA Quadro/Tesla 系列专业 GPU计算卡，保障客户应用程序加速运行，CPU 部分采用 Intel Xeon Scalable 系列 CPU，最大支持 56 核 112 线程，支持多 CPU 技术，最大支持两颗相同型号的 Scalable 系列CPU，顶配 112 核 224 线程，最多 105MB 超大容量缓存，80 通道 PCIE 5.0 带宽；最大支持 2TB DDR4 RECC 内存，支持八通道；系统盘采用高性能 SSD，几秒之内可轻松进入操作系统，搭配大容量机械硬盘，性能与存储齐头并进；选配 Tesla GPU 计算卡，Tesla 作为专用计算显卡，包括了如 ECC memory 等增强稳定性的措施，用户可根据自身的需求选择对应的系列，满足客户多种功能需求。

已测试 10 次平均 30 个工作日完成 99.9% 对测试结果满意

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空间分布函数

计算内容：空间分布函数

空间分布函数（spatial distribution function, SDF）在分子动力学中被用来描述粒子周围环境三维空间的分布情况。在GROMACS中提供了一个gmx spatial的工具来进行计算，其输出文件为Gaussian98 cube 格式，本文简述如何生成cube文件并通过VMD进行绘制SDF。

1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
适合的研究方向包括但不限于：生物、生化、医药、医学、药物、高分子、食品、材料、环境等
可以计算的体系包括但不限于：生物体系、蛋白质、核酸、多肽、药物分子、聚合物、小分子等
常用软件：gromacs，lammps，amber等
可以计算的内容包括但不限于：
蛋白三维模型搭建，如同源建模、从头建模等
分子对接，如蛋白质-小分子，核酸-小分子，小分子-小分子，蛋白-蛋白，蛋白-多肽，蛋白-核酸等
生物三维结构分析，如蛋白在不同pH、温度、电场下的三维结构变化等
动力学研究，如生物体系的弱相互作用分析、受体-配体组装过程、结合自由能分析，材料体系的高分子构象预测、材料与溶液界面性质，粗粒化模拟等
动力学后数据分析，如回旋半径（RMSF）、径向分布函数（RDF）、扩散系数、RMSD、各种能量分析、氢键数量分析、亲疏水性分析等
药物相关内容，如药物衍生物库设计、虚拟筛选、成药性预测、毒性分析、QSAR预测模型构建等
分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
样品要求：结构明确

已测试 581 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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电解液-离子和溶剂的分布

已测试 669 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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虚拟筛选

计算内容：虚拟筛选

已测试 587 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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成药性预测

计算内容：成药性预测

据候选药物结构特征预测其成药性，是一种高效率和低成本发现具有明确药用价值候选小分子新药的重要应用。
1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
适合的研究方向包括但不限于：生物、生化、医药、医学、药物、高分子、食品、材料、环境等
可以计算的体系包括但不限于：生物体系、蛋白质、核酸、多肽、药物分子、聚合物、小分子等
常用软件：gromacs，lammps，amber等
可以计算的内容包括但不限于：
蛋白三维模型搭建，如同源建模、从头建模等
分子对接，如蛋白质-小分子，核酸-小分子，小分子-小分子，蛋白-蛋白，蛋白-多肽，蛋白-核酸等
生物三维结构分析，如蛋白在不同pH、温度、电场下的三维结构变化等
动力学研究，如生物体系的弱相互作用分析、受体-配体组装过程、结合自由能分析，材料体系的高分子构象预测、材料与溶液界面性质，粗粒化模拟等
动力学后数据分析，如回旋半径（RMSF）、径向分布函数（RDF）、扩散系数、RMSD、各种能量分析、氢键数量分析、亲疏水性分析等
药物相关内容，如药物衍生物库设计、虚拟筛选、成药性预测、毒性分析、QSAR预测模型构建等
分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。

样品要求：结构明确

已测试 718 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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聚合物的三维空间结构

计算内容：聚合物的三维空间结构
1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
适合的研究方向包括但不限于：生物、生化、医药、医学、药物、高分子、食品、材料、环境等
可以计算的体系包括但不限于：生物体系、蛋白质、核酸、多肽、药物分子、聚合物、小分子等
常用软件：gromacs，lammps，amber等
可以计算的内容包括但不限于：
蛋白三维模型搭建，如同源建模、从头建模等
分子对接，如蛋白质-小分子，核酸-小分子，小分子-小分子，蛋白-蛋白，蛋白-多肽，蛋白-核酸等
生物三维结构分析，如蛋白在不同pH、温度、电场下的三维结构变化等
动力学研究，如生物体系的弱相互作用分析、受体-配体组装过程、结合自由能分析，材料体系的高分子构象预测、材料与溶液界面性质，粗粒化模拟等
动力学后数据分析，如回旋半径（RMSF）、径向分布函数（RDF）、扩散系数、RMSD、各种能量分析、氢键数量分析、亲疏水性分析等
药物相关内容，如药物衍生物库设计、虚拟筛选、成药性预测、毒性分析、QSAR预测模型构建等
分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
样品要求：结构明确

已测试 652 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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蛋白-小分子对接确定活性位点

计算内容：蛋白-小分子对接确定活性位点
1. 请务必确认理解所选择的计算内容，凡是在结果交付后，另外补加的要求或者提出和原要求不符的其他计算内容，需另外评估是否收费。
2. 请务必提供自己确准的体系结构文件，结果交付后，不接受因为结构提供错误提出的更改模型的售后要求。
3. 请务必确认信息提供准确且没有遗漏，信息尽量提供全面，如果在计算开始以后，又增加信息，视情况协商对原方案的影响以及收费情况。
4. 对于软件版权问题，需要自己解决，如果需要我方解决，请提前沟通说明，我们尽量解决，但不必须确保解决，不接受因此不付款的理由。
5. 最后结果交付内容包括：计算方法（不是计算结果的分析）的说明，最终的结构文件，某些涉及作图所需的数据。除以上内容之外，有其他要求，请提前说明。交付结果后，另外提出的要求，我们会尽量协助解决，但不保证一定能解决。
6. 我们保证计算结果的真实性和有效性，但是无法保证计算结果一定符合您的预期，请务必确认该风险。
7. 我们不承担拒稿责任哦，但是我们会尽量协助解决审稿意见的问题，涉及需要补算的内容，需要另评估收费。
8. 交付结果后，请在一周内反馈结果问题。长时间不查看结果，结果问题反馈时间距离交付结果时间太久的，我们视情况进行问题的解答（因为源数据不一定还有保留，所以一定要及时反馈哦）。
9. 再次提醒：有不懂的可以多交流，但是交付结果后，请不要以“我不懂计算”为理由，提出不对应原方案的另外的要求，我们最终交付结果均以方案为核对参考。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
适合的研究方向包括但不限于：生物、生化、医药、医学、药物、高分子、食品、材料、环境等
可以计算的体系包括但不限于：生物体系、蛋白质、核酸、多肽、药物分子、聚合物、小分子等
常用软件：gromacs，lammps，amber等
可以计算的内容包括但不限于：
蛋白三维模型搭建，如同源建模、从头建模等
分子对接，如蛋白质-小分子，核酸-小分子，小分子-小分子，蛋白-蛋白，蛋白-多肽，蛋白-核酸等
生物三维结构分析，如蛋白在不同pH、温度、电场下的三维结构变化等
动力学研究，如生物体系的弱相互作用分析、受体-配体组装过程、结合自由能分析，材料体系的高分子构象预测、材料与溶液界面性质，粗粒化模拟等
动力学后数据分析，如回旋半径（RMSF）、径向分布函数（RDF）、扩散系数、RMSD、各种能量分析、氢键数量分析、亲疏水性分析等
药物相关内容，如药物衍生物库设计、虚拟筛选、成药性预测、毒性分析、QSAR预测模型构建等
分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。

样品要求：结构明确

已测试 886 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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QSAR

样品要求：结构明确

已测试 479 次平均 15 个工作日完成 100% 对测试结果满意

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